设置

从主屏幕的核酸选项卡选择基因芯片应用后,将出现基因芯片设置屏幕。 要在基因芯片检测屏幕中显示基因芯片设置,请选择 Microarray Setup(基因芯片设置)Settings_Gear00044.png

设置

可用选项

说明

自动命名

打开或关闭

启用后,将为每份样品提供一个默认的基本名称“样品”,后跟序列中的样品编号。 例如,首个样品将命名为“样品 1”,然后是“样品 2”等。您可以编辑默认基本名称和替换样品名称。

样品类型和系数

dsDNA(使用不可编辑的系数 50 ng-cm/µL)

双链 DNA 的广泛接受值

 

ssDNA(使用不可编辑的系数 33 ng-cm/µL)

单链 DNA 的广泛接受值

 

RNA(使用不可编辑的系数 40 ng-cm/µL)

RNA 的广泛接受值

 

寡核苷酸 DNA 使用不可编辑的计算系数,单位为 ng-cm/µL

从用户定义 DNA 碱基序列计算系数。 当选择时,可用的 DNA 碱基单位(即 G、A、T、C)将显示为按键。 通过点击适当的按键定义序列。 系数是根据每个碱基单位的广泛接受值自动计算的。

 

寡核苷酸 RNA 使用不可编辑的计算系数,单位为 ng-cm/µL

从用户定义 RNA 碱基序列计算系数。 当选择时,可用的 RNA 碱基单位(即 G、A、U、C)将显示为按键。 通过点击适当的按键定义序列。 系数是根据每个碱基单位的广泛接受值自动计算的。

 

用户自定义(使用用户指定的系数,单位为 ng-cm/µL)

输入介于 15 ng-cm/µL 和 150 ng-cm/µL 之
间的系数

染料 1/染料 2 类型a

Cy3、5、3.5 或 5.5
Alexa Fluor 488、546、555、594、647 或 660

选择用于标识样品材料的预定义染料,或已经使用染料编辑器添加的染料。

染料 1/染料 2 单位

皮摩尔/微升 (pmol/uL)、微摩尔 (uM) 或毫摩尔 (mM)

选择用于报告染料浓度的单位

分析矫正b

打开或关闭

输入分析矫正波长(单位为 nm)或使用默认值 (340 nm)

从分析波长处的吸光值,减去指定分析矫正波
长处的吸光值,矫正光散射粒子所导致样品吸光度检测的任何偏移。 矫正的值将用于计算
样品浓度。

提示:如果样品经修改在 340 nm 处吸光,则选择不同的矫正波长或关闭分析矫正。

 

a若要添加用户自定义染料或编辑可用的染料列表,请使染料/色谱图编辑器。

b分析矫正仅影响核酸浓度的计算。

染料/色谱图编辑器

使用染料/色谱图编辑器可将用户自定义染料添加到基因芯片设置蛋白芯片设置中的可用染料列表。 您还可以指定该列表中可用的染料。

若要访问染料/色谱图编辑器:

在主屏幕上,选择 Settings(设置) MainGearIcon.png,然后选择 Dye Editor
(染料编辑器)

DyeEditor01.png

 

Custom_Dye01_LC.png

 

染料/色谱图编辑器提供了以下操作:

添加用户自定义染料

1. 在染料编辑器中,选择newDye.png可显示添加染料框。

2. 输入新染料的唯一 Name(名称)(使用本地控制软件时点击字段可显示键盘,选择 Done(完成)按键可关闭键盘)。

3. 选择将要使用的默认 Unit(单位)可显示染料浓度。

4. 输入染料的 Extinction Coefficient(消光系数)(或摩尔吸光常数),
单位为 L/mole-cm(通常由染料制造商提供)。

5. 指定波长,单位为 nm(介于 350 nm 和 840 nm 之间),用于检测染料的
吸光度。

6. 指定 260 nm 和 280 nm 处的染料矫正值

7. 选择 Save (保存) 可关闭 Add Dye (添加染料) 框。

基因芯片设置和蛋白芯片设置中的 Dye 1(染料 1)Dye 2(染料 2)列表将显示新的用户自定义染料。

注  若要确定染料矫正值(如果染料制造商未提供):

使用仪器检测纯染料并记录 260 nm、280 nm 和染料分析波长处的吸光度(请参阅上文)

计算 A260/A染料波长的比率,并输入该值进行 260 nm 矫正

计算 A280/A染料波长的比率,并输入该值进行 280 nm 矫正

如果在检测之前选择用户自定义染料,将报告该染料的吸光度和浓度值,并对检测的样品吸光度值和所得到的样品浓度和纯度比应用矫正。

编辑用户自定义染料

提示  在软件中预定义的染料不能被编辑。

1. 在染料编辑器中,选择需要编辑的期望用户自定义染料该行的 Kebab01.png

2. 选择 Edit_Icon00047.png

3. 编辑任何条目或设置。

4. 选择 Save(保存)。

删除用户自定义染料

提示  在软件中预定义的染料不能被删除。

1. 在染料编辑器中,使用每种期望的用户自定义染料左侧的复选框,选择要删除的一种或多种用户自定义染料。

2. 选择 Trash_icon00049.png

3. 选择 Yes(是)可确认删除。

注意   删除用户自定义染料将永久性从该软件中删除染料和所有相关信息。