Paramètres

L’écran de configuration de l’application Protein & Labels apparaît après avoir sélectionné cette application depuis l’onglet Proteins (protéines) sur la page d’accueil. Pour afficher les paramètres de l’application Proteins & Labels sur l’écran de mesure des Proteins & Labels, sélectionnez .Settings_Gear00095.png

Pro+lab_setup.png

 

 

Paramètre

Options disponibles

Coefficient d’ext. de masse (l/gm-cm)

Description

Sample type (type d’échantillon)a

1 Abs = 1 mg/ml

BSA

IgG

Lysozyme

Autre protéine
(e + MW)

Autre protéine
(e1%)

Référence générale

6,7

13,7

26,4

coefficient d’extinction molaire/poids
moléculaire saisi par l’utilisateur

coefficient d’extinction de masse défini par l’utilisateur

Appuyez sur Sample type (type d’échantillon) pour une description détaillée de chaque paramètre disponible.

Chaque type d’échantillon applique un coefficient d’extinction unique aux calculs de concentration des protéines. Si vous connaissez le coefficient d’extinction de l’échantillon, choisissez l’option e + MW (molaire) ou e1 % (masse) et saisissez sa valeur. Dans le cas contraire, calculez le coefficient d’extinction ou choisissez l’option qui correspond le mieux à la solution d’échantillon. Si vous avez seulement besoin d’une estimation approximative de la concentration des protéines et ne connaissez pas le coefficient d’extinction de l’échantillon, sélectionnez l’option 1 Abs = 1 mg/ml dans le champ du type d’échantillon.

 

Conseil : il est préférable que le coefficient d’extinction soit déterminé de manière empirique à l’aide d’une solution de la protéine à l’étude dont la concentration est connue et diluée dans le même tampon.

Analysis Correction (correction d’analyse)b

Activé ou désactivé

Saisir la longueur d’onde de correction d’analyse en nm ou utiliser la valeur par défaut (340 nm)

S.O.

Corrige tout écart dans l’absorbance de l’échantillon causé par certaines particules capables de diffuser la lumière en soustrayant la valeur d’absorbance obtenue à une longueur d’onde de correction d’analyse spécifiée à la valeur d’absorbance obtenue à la longueur d’onde de l’analyse. La valeur corrigée est utilisée pour calculer la concentration de l’échantillon.

Conseil : si l’échantillon présente une modification qui absorbe la lumière à 340 nm, sélectionnez une autre longueur d’onde de correction ou désactivez l’option de correction d’analyse.

 

Auto Naming (nom automatique)

Activé ou désactivé

S.O.

Lorsque cette fonction est activée, chaque échantillon se voit attribuer un nom par défaut commençant par le mot « sample » suivi du numéro de l’échantillon dans la séquence. Par exemple, le premier échantillon sera nommé « Sample 1 », le deuxième « Sample 2 », et ainsi de suite. Vous pouvez modifier le nom de base par défaut et remplacer tout nom d’échantillon.

Dye 1/Dye 2 Type (type de colorant 1/2)c

Cy3, 5, 3.5, ou 5.5,
Alexa Fluor 488, 546, 555, 594, 647, ou 660

Consultez la rubrique Éditeur de colorants/chromophores pour connaître les valeurs spécifiques de chaque colorant.

Sélectionnez le colorant prédéfini utilisé pour marquer l’échantillon ou un colorant que vous avez ajouté à l’aide de l’éditeur de colorants/chromophores.

Dye 1/Dye 2 Unit (unité du colorant 1/2)

picomoles/microlitre (pmol/ul), micromoles (uM) ou millimoles (mM)

S.O.

Sélectionnez l’unité pour rapporter les concentrations de colorant.

sloping dye correction (correction de l’inclinaison de la ligne de base d’un colorant)d

Activé ou désactivé

 

Corrige les mesures d’absorbance du colorant pour tout écart causé par les particules capables de diffuser la lumière en soustrayant la valeur d’absorbance d’une ligne de base inclinée entre 400 nm to 850 nm à la valeur d’absorbance à la longueur d’onde d’analyse du colorant.

aPour ajouter ou modifier une protéine personnalisée, utilisez l’éditeur de protéines.

bLa correction d’analyse influe uniquement sur le calcul de la concentration des protéines.

cPour ajouter un colorant non répertorié ou modifier la liste des colorants inclus, utilisez l’éditeur de colorants/chromophores.

dLa correction de l’inclinaison de la ligne de base influe uniquement sur les calculs de concentration des colorants.

 

Sujets connexes

Paramètres de l’instrument

Éditeur de protéines

Éditeur de colorants/chromophores