General Description

DNA pcoblast_verA

Entire molecule length: 3907 bp

Restriction Map

Enzyme

# of cuts

Positions

AatII

1

3843

Acc65I

1

1661

AccI

1

419

AciI

40

76(c) 115(c) 125(c) 151(c) 189(c) 202 228 285(c) 917 999(c) 1066(c) 1359(c) 1456 1473 1718 1821 1877(c) 1887(c) 1911 1954(c) 1961(c) 1982(c) 2073 2101 2228 2247 2368 2478(c) 2613 2622(c) 2984 3075 3266(c) 3312 3433(c) 3477 3554 3663 3762(c) 3809

AcsI

2

1575 1673

AcyI

3

237 3458 3840

AflIII

1

2028

AluI

22

45 64 309 402 900 1005 1235 1342 1516 1520 1540 1669 1693 1788 1852 1970 2196 2332 2589 3110 3210 3273

Alw44I

3

178 2342 3588

AlwI

13

425(c) 438 1113 1446(c) 1663 2589(c) 2675(c) 2677 2773(c) 2774 3237(c) 3554 3558(c)

AlwNI

1

2444

AosI

3

259 965 3143

ApaLI

3

178 2342 3588

ApoI

2

1575 1673

AseI

3

1799 1858 3093

AsnI

3

1799 1858 3093

Asp700

1

3520

Asp718

1

1661

AspEI

1

2921

AspHI

5

182 1671 2346 3507 3592

AvaI

2

1436 1506

AvaII

4

957 1404 3059 3281

AviII

3

259 965 3143

BamHI

1

430

BanI

5

236 1072 1661 1772 2869

BanII

2

1062 1671

BbsI

1

883

BbvI

19

54 242(c) 315(c) 909 977(c) 980(c) 983(c) 1014 1153(c) 1549 1839(c) 1920(c) 1938(c) 2357(c) 2447 2450 2656 2959(c) 3350

BcgI

3

1304(c) 1440 3460

BfaI

8

425 907 1275 1517 1610 2523 2776 3111

BglI

2

252 3041

BmyI

8

182 987 1062 1416 1671 2346 3507 3592

BpmI

1

2991(c)

Bpu1102I

1

1338

BpuAI

1

883

BsaBI

1

1096

BsaHI

3

237 3458 3840

BsaI

1

2982(c)

BsaJI

6

355 1101 1408 1409 1767 2188

BsaWI

4

433 2234 2381 3212

BsgI

1

1515

BsiEI

9

280 917 1033 1225 1372 1944 2368 3291 3440

BsiHKAI

5

182 1671 2346 3507 3592

BsiYI

9

54 440 1069 1462 1876 2050 2068 2234 2513

BslI

9

54 440 1069 1462 1876 2050 2068 2234 2513

BsmAI

5

4 46(c) 817 2982(c) 3758

BsmFI

2

970 1390(c)

BsmI

1

1605(c)

Bsp1286I

8

182 987 1062 1416 1671 2346 3507 3592

BspHI

3

2748 3756 3861

BspMI

1

405(c)

BspWI

27

186 236 243 252 282 403 675 892 897 916 996 999 1002 1057 1072 1266 1275 1343 1348 1478 1772 1816 1900 1967 2081 2653 3041

BsrBI

3

1720(c) 1961 3762

BsrDI

2

2982 3156(c)

BsrFI

2

1367 3001

BsrI

13

366(c) 392(c) 932 956 1828(c) 2436 2449 2561(c) 2967(c) 3085(c) 3128(c) 3397 3567(c)

BstNI

7

356 1102 1410 1768 2056 2177 2190

BstUI

14

4 6 109 1029 1267 1269 1359 1875 1877 2075 2656 2986 3479 3811

BstYI

7

430 2669 2680 2766 2778 3546 3563

CelII

1

1338

CfoI

20

6 109 239 260 897 966 1269 1812 1877 1905 1938 2208 2275 2375 2549 2658 3051 3144 3481 3813

Cfr10I

2

1367 3001

Csp6I

4

169 639 1662 3400

DdeI

8

172 1252 1338 2303 2712 2878 3418 3844

DpnI

23

279 432 1032 1093 1107 1444 1453 1469 1500 1657 2596 2671 2682 2690 2768 2780 2885 3226 3244 3290 3548 3565 3601

DpnII

23

277 430 1030 1091 1105 1442 1451 1467 1498 1655 2594 2669 2680 2688 2766 2778 2883 3224 3242 3288 3546 3563 3599

DraI

3

2787 2806 3498

DraII

3

957 1385 3897

DrdI

3

98 885 2136

DsaV

12

47 82 354 1100 1408 1766 2054 2175 2188 2406 3102 3453

EaeI

6

389 568 799 914 1867 3309

EagI

1

914

Eam1105I

1

2921

EarI

3

297 1912 3716

Ecl136II

1

1669

EclXI

1

914

Eco57I

3

895 2576 3588(c)

EcoO109I

3

957 1385 3897

EcoRI

1

1673

EcoRII

7

354 1100 1408 1766 2054 2175 2188

Esp3I

2

4 46(c)

EspI

1

1338

Fnu4HI

29

43 152 256 329 898 917 991 994 997 1000 1003 1167 1473 1538 1853 1934 1952 1955 2073 2228 2371 2436 2439 2645 2973 3312 3339 3434 3663

FnuDII

14

4 6 109 1029 1267 1269 1359 1875 1877 2075 2656 2986 3479 3811

FokI

8

91 335 809 849(c) 1084(c) 2887(c) 3068(c) 3355(c)

FspI

3

259 965 3143

HaeII

3

240 1906 2276

HaeIII

18

289 391 570 801 916 1300 1367 1386 1512 1869 2043 2054 2072 2506 2964 3044 3311 3898

HgaI

5

98(c) 875(c) 2139 2717 3447(c)

HgiAI

5

182 1671 2346 3507 3592

HhaI

20

6 109 239 260 897 966 1269 1812 1877 1905 1938 2208 2275 2375 2549 2658 3051 3144 3481 3813

HinP1I

20

4 107 237 258 895 964 1267 1810 1875 1903 1936 2206 2273 2373 2547 2656 3049 3142 3479 3811

HincII

1

420

HindII

1

420

HindIII

1

400

HinfI

9

421 822 1154 1379 1863 1928 2003 2399 2916

HpaII

14

49 83 434 1368 1746 2235 2382 2408 2598 3002 3036 3103 3213 3455

HphI

8

25 34 1452 2764(c) 2991(c) 3407 3613(c) 3648

ItaI

29

43 152 256 329 898 917 991 994 997 1000 1003 1167 1473 1538 1853 1934 1952 1955 2073 2228 2371 2436 2439 2645 2973 3312 3339 3434 3663

KasI

1

236

KpnI

1

1665

Ksp632I

3

297 1912 3716

MaeI

8

425 907 1275 1517 1610 2523 2776 3111

MaeII

7

375 534 641 2731 3147 3520 3840

MaeIII

12

57 348 368 1549 2384 2447 2563 2846 3177 3235 3388 3576

MamI

1

1096

MboI

23

277 430 1030 1091 1105 1442 1451 1467 1498 1655 2594 2669 2680 2688 2766 2778 2883 3224 3242 3288 3546 3563 3599

MboII

11

284(c) 831 888 914(c) 1077(c) 1899(c) 2690 2761(c) 3516(c) 3594(c) 3703(c)

McrI

9

280 917 1033 1225 1372 1944 2368 3291 3440

MluNI

2

570 801

MnlI

21

40 300 421(c) 502 840 1181 1181(c) 1261 1356(c) 1502(c) 1515 1877(c) 1927 2136(c) 2210 2460(c) 2860(c) 2941(c) 3088 3294 3888(c)

MscI

2

570 801

MseI

16

143 340 537 692 744 1799 1858 2734 2786 2791 2805 2858 3093 3132 3497 3869

MslI

4

1438 3173 3332 3691

MspA1I

7

115 309 1005 1852 2370 2615 3556

MspI

14

49 83 434 1368 1746 2235 2382 2408 2598 3002 3036 3103 3213 3455

MvaI

7

356 1102 1410 1768 2056 2177 2190

MvnI

14

4 6 109 1029 1267 1269 1359 1875 1877 2075 2656 2986 3479 3811

MwoI

27

186 236 243 252 282 403 675 892 897 916 996 999 1002 1057 1072 1266 1275 1343 1348 1478 1772 1816 1900 1967 2081 2653 3041

NarI

1

237

NciI

5

49 84 2408 3104 3455

NdeI

1

185

NdeII

23

277 430 1030 1091 1105 1442 1451 1467 1498 1655 2594 2669 2680 2688 2766 2778 2883 3224 3242 3288 3546 3563 3599

NheI

1

1516

NlaIII

14

42 410 454 1427 1651 1687 2032 2752 3243 3253 3331 3367 3760 3865

NlaIV

16

238 432 488 780 958 1074 1406 1663 1774 2060 2099 2871 2965 3006 3217 3807

NruI

1

1029

NspI

3

42 410 2032

PaeR7I

1

1506

PleI

4

415(c) 1922(c) 2407 2910(c)

PpuMI

1

957

Psp1406I

3

534 3147 3520

PstI

1

416

PvuI

3

280 1033 3291

PvuII

3

309 1005 1852

RcaI

3

2748 3756 3861

RsaI

4

170 640 1663 3401

SacI

1

1671

SalI

1

418

SapI

1

1912

Sau3AI

23

277 430 1030 1091 1105 1442 1451 1467 1498 1655 2594 2669 2680 2688 2766 2778 2883 3224 3242 3288 3546 3563 3599

Sau96I

10

287 957 1365 1385 1404 2963 3042 3059 3281 3897

ScaI

1

3401

ScrFI

12

49 84 356 1102 1410 1768 2056 2177 2190 2408 3104 3455

SfaNI

14

69(c) 163 199(c) 239 871 928 1060 1106 1207(c) 1577 2125 3177 3368(c) 3617

SfcI

5

412 881 2293 2484 3162

SnoI

3

178 2342 3588

SphI

1

410

SspI

1

3725

TaqI

7

419 1090 1242 1507 1671 2128 3572

TfiI

5

822 1154 1379 1863 2003

ThaI

14

4 6 109 1029 1267 1269 1359 1875 1877 2075 2656 2986 3479 3811

Tru9I

16

143 340 537 692 744 1799 1858 2734 2786 2791 2805 2858 3093 3132 3497 3869

Tsp509I

11

760 767 1161 1575 1673 1708 1725 1800 2788 3094 3349

XbaI

1

424

XhoI

1

1506

XhoII

7

430 2669 2680 2766 2778 3546 3563

XmaIII

1

914

XmnI

1

3520

No cuts: AatI, AccIII, AflII, AgeI, ApaI, AscI, AspI, AsuII, AvrII, BbrPI, BclI, BfrI, BglII, BlnI, BsaAI, BseAI, BsiWI, Bsp120I, BspDI, BspEI, BsrGI, BssHII, Bst1107I, BstBI, BstEII, BstXI, Bsu36I, ClaI, Csp45I, DraIII, DsaI, Eco47III, EcoNI, EcoRV, HpaI, KspI, MfeI, MluI, MroI, MunI, NaeI, NcoI, NgoMI, NotI, NsiI, NspV, PacI, PflMI, PinAI, PmaCI, PmeI, PmlI, Ppu10I, RsrII, SacII, SexAI, SfiI, SfuI, SgrAI, SmaI, SnaBI, SpeI, SspBI, StuI, StyI, SwaI, Tth111I, Van91I, XcmI, XmaI

Enzyme	# of cuts	Positions
AatII	1	3843
Acc65I	1	1661
AccI	1	419
AciI	40	76(c) 115(c) 125(c) 151(c) 189(c) 202 228 285(c) 917 999(c) 1066(c) 1359(c) 1456 1473 1718 1821 1877(c) 1887(c) 1911 1954(c) 1961(c) 1982(c) 2073 2101 2228 2247 2368 2478(c) 2613 2622(c) 2984 3075 3266(c) 3312 3433(c) 3477 3554 3663 3762(c) 3809
AcsI	2	1575 1673
AcyI	3	237 3458 3840
AflIII	1	2028
AluI	22	45 64 309 402 900 1005 1235 1342 1516 1520 1540 1669 1693 1788 1852 1970 2196 2332 2589 3110 3210 3273
Alw44I	3	178 2342 3588
AlwI	13	425(c) 438 1113 1446(c) 1663 2589(c) 2675(c) 2677 2773(c) 2774 3237(c) 3554 3558(c)
AlwNI	1	2444
AosI	3	259 965 3143
ApaLI	3	178 2342 3588
ApoI	2	1575 1673
AseI	3	1799 1858 3093
AsnI	3	1799 1858 3093
Asp700	1	3520
Asp718	1	1661
AspEI	1	2921
AspHI	5	182 1671 2346 3507 3592
AvaI	2	1436 1506
AvaII	4	957 1404 3059 3281
AviII	3	259 965 3143
BamHI	1	430
BanI	5	236 1072 1661 1772 2869
BanII	2	1062 1671
BbsI	1	883
BbvI	19	54 242(c) 315(c) 909 977(c) 980(c) 983(c) 1014 1153(c) 1549 1839(c) 1920(c) 1938(c) 2357(c) 2447 2450 2656 2959(c) 3350
BcgI	3	1304(c) 1440 3460
BfaI	8	425 907 1275 1517 1610 2523 2776 3111
BglI	2	252 3041
BmyI	8	182 987 1062 1416 1671 2346 3507 3592
BpmI	1	2991(c)
Bpu1102I	1	1338
BpuAI	1	883
BsaBI	1	1096
BsaHI	3	237 3458 3840
BsaI	1	2982(c)
BsaJI	6	355 1101 1408 1409 1767 2188
BsaWI	4	433 2234 2381 3212
BsgI	1	1515
BsiEI	9	280 917 1033 1225 1372 1944 2368 3291 3440
BsiHKAI	5	182 1671 2346 3507 3592
BsiYI	9	54 440 1069 1462 1876 2050 2068 2234 2513
BslI	9	54 440 1069 1462 1876 2050 2068 2234 2513
BsmAI	5	4 46(c) 817 2982(c) 3758
BsmFI	2	970 1390(c)
BsmI	1	1605(c)
Bsp1286I	8	182 987 1062 1416 1671 2346 3507 3592
BspHI	3	2748 3756 3861
BspMI	1	405(c)
BspWI	27	186 236 243 252 282 403 675 892 897 916 996 999 1002 1057 1072 1266 1275 1343 1348 1478 1772 1816 1900 1967 2081 2653 3041
BsrBI	3	1720(c) 1961 3762
BsrDI	2	2982 3156(c)
BsrFI	2	1367 3001
BsrI	13	366(c) 392(c) 932 956 1828(c) 2436 2449 2561(c) 2967(c) 3085(c) 3128(c) 3397 3567(c)
BstNI	7	356 1102 1410 1768 2056 2177 2190
BstUI	14	4 6 109 1029 1267 1269 1359 1875 1877 2075 2656 2986 3479 3811
BstYI	7	430 2669 2680 2766 2778 3546 3563
CelII	1	1338
CfoI	20	6 109 239 260 897 966 1269 1812 1877 1905 1938 2208 2275 2375 2549 2658 3051 3144 3481 3813
Cfr10I	2	1367 3001
Csp6I	4	169 639 1662 3400
DdeI	8	172 1252 1338 2303 2712 2878 3418 3844
DpnI	23	279 432 1032 1093 1107 1444 1453 1469 1500 1657 2596 2671 2682 2690 2768 2780 2885 3226 3244 3290 3548 3565 3601
DpnII	23	277 430 1030 1091 1105 1442 1451 1467 1498 1655 2594 2669 2680 2688 2766 2778 2883 3224 3242 3288 3546 3563 3599
DraI	3	2787 2806 3498
DraII	3	957 1385 3897
DrdI	3	98 885 2136
DsaV	12	47 82 354 1100 1408 1766 2054 2175 2188 2406 3102 3453
EaeI	6	389 568 799 914 1867 3309
EagI	1	914
Eam1105I	1	2921
EarI	3	297 1912 3716
Ecl136II	1	1669
EclXI	1	914
Eco57I	3	895 2576 3588(c)
EcoO109I	3	957 1385 3897
EcoRI	1	1673
EcoRII	7	354 1100 1408 1766 2054 2175 2188
Esp3I	2	4 46(c)
EspI	1	1338
Fnu4HI	29	43 152 256 329 898 917 991 994 997 1000 1003 1167 1473 1538 1853 1934 1952 1955 2073 2228 2371 2436 2439 2645 2973 3312 3339 3434 3663
FnuDII	14	4 6 109 1029 1267 1269 1359 1875 1877 2075 2656 2986 3479 3811
FokI	8	91 335 809 849(c) 1084(c) 2887(c) 3068(c) 3355(c)
FspI	3	259 965 3143
HaeII	3	240 1906 2276
HaeIII	18	289 391 570 801 916 1300 1367 1386 1512 1869 2043 2054 2072 2506 2964 3044 3311 3898
HgaI	5	98(c) 875(c) 2139 2717 3447(c)
HgiAI	5	182 1671 2346 3507 3592
HhaI	20	6 109 239 260 897 966 1269 1812 1877 1905 1938 2208 2275 2375 2549 2658 3051 3144 3481 3813
HinP1I	20	4 107 237 258 895 964 1267 1810 1875 1903 1936 2206 2273 2373 2547 2656 3049 3142 3479 3811
HincII	1	420
HindII	1	420
HindIII	1	400
HinfI	9	421 822 1154 1379 1863 1928 2003 2399 2916
HpaII	14	49 83 434 1368 1746 2235 2382 2408 2598 3002 3036 3103 3213 3455
HphI	8	25 34 1452 2764(c) 2991(c) 3407 3613(c) 3648
ItaI	29	43 152 256 329 898 917 991 994 997 1000 1003 1167 1473 1538 1853 1934 1952 1955 2073 2228 2371 2436 2439 2645 2973 3312 3339 3434 3663
KasI	1	236
KpnI	1	1665
Ksp632I	3	297 1912 3716
MaeI	8	425 907 1275 1517 1610 2523 2776 3111
MaeII	7	375 534 641 2731 3147 3520 3840
MaeIII	12	57 348 368 1549 2384 2447 2563 2846 3177 3235 3388 3576
MamI	1	1096
MboI	23	277 430 1030 1091 1105 1442 1451 1467 1498 1655 2594 2669 2680 2688 2766 2778 2883 3224 3242 3288 3546 3563 3599
MboII	11	284(c) 831 888 914(c) 1077(c) 1899(c) 2690 2761(c) 3516(c) 3594(c) 3703(c)
McrI	9	280 917 1033 1225 1372 1944 2368 3291 3440
MluNI	2	570 801
MnlI	21	40 300 421(c) 502 840 1181 1181(c) 1261 1356(c) 1502(c) 1515 1877(c) 1927 2136(c) 2210 2460(c) 2860(c) 2941(c) 3088 3294 3888(c)
MscI	2	570 801
MseI	16	143 340 537 692 744 1799 1858 2734 2786 2791 2805 2858 3093 3132 3497 3869
MslI	4	1438 3173 3332 3691
MspA1I	7	115 309 1005 1852 2370 2615 3556
MspI	14	49 83 434 1368 1746 2235 2382 2408 2598 3002 3036 3103 3213 3455
MvaI	7	356 1102 1410 1768 2056 2177 2190
MvnI	14	4 6 109 1029 1267 1269 1359 1875 1877 2075 2656 2986 3479 3811
MwoI	27	186 236 243 252 282 403 675 892 897 916 996 999 1002 1057 1072 1266 1275 1343 1348 1478 1772 1816 1900 1967 2081 2653 3041
NarI	1	237
NciI	5	49 84 2408 3104 3455
NdeI	1	185
NdeII	23	277 430 1030 1091 1105 1442 1451 1467 1498 1655 2594 2669 2680 2688 2766 2778 2883 3224 3242 3288 3546 3563 3599
NheI	1	1516
NlaIII	14	42 410 454 1427 1651 1687 2032 2752 3243 3253 3331 3367 3760 3865
NlaIV	16	238 432 488 780 958 1074 1406 1663 1774 2060 2099 2871 2965 3006 3217 3807
NruI	1	1029
NspI	3	42 410 2032
PaeR7I	1	1506
PleI	4	415(c) 1922(c) 2407 2910(c)
PpuMI	1	957
Psp1406I	3	534 3147 3520
PstI	1	416
PvuI	3	280 1033 3291
PvuII	3	309 1005 1852
RcaI	3	2748 3756 3861
RsaI	4	170 640 1663 3401
SacI	1	1671
SalI	1	418
SapI	1	1912
Sau3AI	23	277 430 1030 1091 1105 1442 1451 1467 1498 1655 2594 2669 2680 2688 2766 2778 2883 3224 3242 3288 3546 3563 3599
Sau96I	10	287 957 1365 1385 1404 2963 3042 3059 3281 3897
ScaI	1	3401
ScrFI	12	49 84 356 1102 1410 1768 2056 2177 2190 2408 3104 3455
SfaNI	14	69(c) 163 199(c) 239 871 928 1060 1106 1207(c) 1577 2125 3177 3368(c) 3617
SfcI	5	412 881 2293 2484 3162
SnoI	3	178 2342 3588
SphI	1	410
SspI	1	3725
TaqI	7	419 1090 1242 1507 1671 2128 3572
TfiI	5	822 1154 1379 1863 2003
ThaI	14	4 6 109 1029 1267 1269 1359 1875 1877 2075 2656 2986 3479 3811
Tru9I	16	143 340 537 692 744 1799 1858 2734 2786 2791 2805 2858 3093 3132 3497 3869
Tsp509I	11	760 767 1161 1575 1673 1708 1725 1800 2788 3094 3349
XbaI	1	424
XhoI	1	1506
XhoII	7	430 2669 2680 2766 2778 3546 3563
XmaIII	1	914
XmnI	1	3520