General Description

        DNA pLysS

        Entire molecule length: 4886 bp

Restriction Map

Enzyme

# of cuts

Positions

AccI

2

596 2789

AccIII

2

6 4080

AciI

57

26(c) 569 588(c) 708 751(c) 758(c) 780(c) 833 835(c) 861 952(c) 1005 1017 1110 1328 1340(c) 1534(c) 1676(c) 1784 1793 1796 1980 2562(c) 2715(c) 2718(c) 2721(c) 2840(c) 2860 2939 2979(c) 3028 3075(c) 3160(c) 3175 3243(c) 3276 3301 3346 3370 3382(c) 3424(c) 3478(c) 3531 3547 3553(c) 3634(c) 3772(c) 3803 3867(c) 3900 3905 3934(c) 3954 4309(c) 4379 4454 4548(c)

AcsI

3

2 4350 4362

AcyI

6

2087 2230 2551 2572 2686 3343

AflII

1

2058

AgeI

4

670 993 3824 4284

AluI

13

106 225 234 518 535 1074 1307 1511 1526 2824 3227 3918 4863

AlwI

6

1865(c) 1878 2507(c) 2520 3242 4091

AlwNI

3

538 1186 4166

AosI

4

1757 1945 3495 3593

ApoI

3

2 4350 4362

AseI

2

1407 2009

AsnI

2

1407 2009

Asp700

1

640

AspEI

1

3851

AspHI

5

495 1775 2728 3315 3606

AspI

1

4344

AsuII

2

1320 4360

AvaI

1

3562

AvaII

6

2506 2936 3024 3273 3576 3618

AviII

4

1757 1945 3495 3593

BamHI

2

1870 2512

BanI

11

1571 1614 2086 2550 2571 2685 2903 3342 3426 3997 4422

BanII

2

2612 2626

BbsI

4

2115 2867(c) 3730(c) 3961(c)

BbvI

16

437(c) 652(c) 1099(c) 1189 1192 1708(c) 1872(c) 2739(c) 2922 3555 3579 3683(c) 3686(c) 3776(c) 4016 4088(c)

BcgI

3

2178 2834(c) 3928(c)

BclI

1

4184

BfaI

4

585 1426 1725 3626

BfrI

1

2058

BglI

2

3072 3306

BmyI

8

495 1775 2612 2626 2728 3315 3606 4425

BpmI

4

479(c) 2969 3523(c) 4772(c)

BpuAI

4

2115 2867(c) 3730(c) 3961(c)

BsaAI

2

313 3786

BsaBI

1

4088

BsaHI

6

2087 2230 2551 2572 2686 3343

BsaI

1

1993

BsaJI

20

349 350 833 947 1286 1610 1624 1911 2017 2665 2671 3304 3506 3584 4020 4026 4208 4587 4656 4657

BsaWI

11

6 670 993 1123 2830 3824 3911 3924 4080 4269 4284

BseAI

2

6 4080

BsgI

2

651(c) 4051(c)

BsiEI

6

741 1110 1784 2793 3079 4343

BsiHKAI

5

495 1775 2728 3315 3606

BsiYI

22

344 1676 1767 1867 1898 2099 2670 2671 2717 2747 2765 2833 3458 3507 3585 3911 3927 4027 4028 4211 4342 4663

BslI

22

344 1676 1767 1867 1898 2099 2670 2671 2717 2747 2765 2833 3458 3507 3585 3911 3927 4027 4028 4211 4342 4663

BsmAI

5

331 1030 1993 2312 4664(c)

BsmFI

8

386 506(c) 2519 2689 3010(c) 3235 3763(c) 4002(c)

BsmI

3

15(c) 3496 4494(c)

Bsp1286I

8

495 1775 2612 2626 2728 3315 3606 4425

BspDI

1

1519

BspEI

2

6 4080

BspHI

2

2095 2626

BspMI

1

3191(c)

BspWI

39

231 435 499 764 1013 1174 1661 1727 1734 1792 1814 1848 2086 2348 2357 2548 2559 2580 2771 2912 2938 3063 3072 3081 3179 3183 3188 3197 3297 3306 3555 3564 3589 3631 3696 3719 3798 4006 4554

BsrBI

2

758 3867

BsrDI

1

4875(c)

BsrFI

12

670 993 1226 1655 2538 2547 2906 3066 3420 3824 4000 4284

BsrGI

1

2455

BsrI

17

201(c) 496(c) 604 1178 1191 1279(c) 1705(c) 1800(c) 2033(c) 2368 2752 2817(c) 3026 3275 3652 4234 4647

Bst1107I

1

597

BstBI

2

1320 4360

BstNI

12

351 379 791 802 937 949 1626 3197 3580 4410 4658 4714

BstUI

19

835 1019 1372 1842 2106 2840 2955 3084 3111 3116 3177 3243 3372 3382 3527 3553 3675 3772 3934

BstYI

3

1870 2512 4083

Bsu36I

1

4235

CfoI

30

431 584 967 1117 1226 1268 1374 1598 1730 1758 1946 2089 2106 2118 2553 2574 2634 2688 2840 2915 2955 3086 3345 3496 3558 3594 3934 4009 4063 4146

Cfr10I

12

670 993 1226 1655 2538 2547 2906 3066 3420 3824 4000 4284

ClaI

1

1519

Csp45I

2

1320 4360

Csp6I

6

126 1659 2124 2302 2456 4474

DdeI

11

230 1045 1308 2127 2256 3718 3848 3885 4221 4235 4668

DpnI

16

277 320 404 1387 1398 1845 1872 2514 2605 2964 3236 3267 3282 3599 4085 4186

DpnII

16

275 318 402 1385 1396 1843 1870 2512 2603 2962 3234 3265 3280 3597 4083 4184

DraI

3

86 2450 4633

DraII

5

2506 2661 3576 3618 4031

DrdI

1

4344

DsaI

7

833 2017 2665 3584 4026 4208 4587

DsaV

23

266 349 358 377 789 800 935 947 1051 1148 1624 1664 2508 2670 3195 3394 3578 3620 4020 4342 4408 4656 4712

EaeI

8

1014 1790 2536 2668 3076 3581 4023 4623

EagI

1

3076

Eam1105I

1

3851

EarI

1

1453

EclXI

1

3076

Eco47III

5

583 1729 2633 2914 4145

Eco57I

2

1485 3814

EcoNI

1

2763

EcoO109I

5

2506 2661 3576 3618 4031

EcoRI

1

2

EcoRII

12

349 377 789 800 935 947 1624 3195 3578 4408 4656 4712

EcoRV

1

1682

Esp3I

3

331 2312 4664(c)

Fnu4HI

38

451 666 752 833 836 953 1017 1113 1178 1181 1722 1793 1796 1886 2716 2719 2753 2860 2911 3076 3161 3244 3301 3346 3425 3544 3547 3554 3568 3697 3700 3790 3868 3954 4005 4102 4310 4549

FnuDII

19

835 1019 1372 1842 2106 2840 2955 3084 3111 3116 3177 3243 3372 3382 3527 3553 3675 3772 3934

FokI

7

22 1593(c) 1641 3137 3182 4110 4362(c)

FspI

4

1757 1945 3495 3593

HaeII

13

585 1731 2090 2119 2554 2575 2635 2689 2916 3346 4010 4064 4147

HaeIII

25

48 93 348 832 1016 1669 1792 1877 2538 2662 2670 2734 2968 3057 3078 3129 3186 3399 3583 3870 4025 4033 4233 4625 4712

HgaI

12

427(c) 665(c) 899 2177(c) 2238 2417(c) 2536 2775(c) 3090 3122 3366(c) 3516(c)

HgiAI

5

495 1775 2728 3315 3606

HhaI

30

431 584 967 1117 1226 1268 1374 1598 1730 1758 1946 2089 2106 2118 2553 2574 2634 2688 2840 2915 2955 3086 3345 3496 3558 3594 3934 4009 4063 4146

HinP1I

30

429 582 965 1115 1224 1266 1372 1596 1728 1756 1944 2087 2104 2116 2551 2572 2632 2686 2838 2913 2953 3084 3343 3494 3556 3592 3932 4007 4061 4144

HincII

2

2790 3856

HindII

2

2790 3856

HindIII

1

1524

HinfI

11

725 1141 2369 2437 2769 2989 3143 3441 3662 3852 4539

HpaII

36

7 49 268 360 572 671 994 1052 1124 1150 1227 1656 1665 1874 2510 2524 2539 2548 2671 2831 2907 3067 3157 3395 3421 3622 3825 3912 3925 4001 4022 4081 4270 4285 4343 4765

HphI

16

304 456 1271 1613(c) 2537(c) 2582(c) 3436(c) 3657(c) 3839 4603 4645(c) 4657 4713(c) 4849(c) 4851 4857(c)

ItaI

38

451 666 752 833 836 953 1017 1113 1178 1181 1722 1793 1796 1886 2716 2719 2753 2860 2911 3076 3161 3244 3301 3346 3425 3544 3547 3554 3568 3697 3700 3790 3868 3954 4005 4102 4310 4549

KasI

5

2086 2550 2571 2685 3342

Ksp632I

1

1453

KspI

1

836

MaeI

4

585 1426 1725 3626

MaeII

10

312 324 2442 3038 3094 3683 3707 3785 4628 4803

MaeIII

16

410 553 1126 1259 1281 1619 1707 2028 2139 2249 3017 3284 3888 4257 4725 4830

MamI

1

4088

MboI

16

275 318 402 1385 1396 1843 1870 2512 2603 2962 3234 3265 3280 3597 4083 4184

MboII

13

397(c) 806 817 1406 1440(c) 2034(c) 2120 2613 2867(c) 3138(c) 3730(c) 3961(c) 4618

McrI

6

741 1110 1784 2793 3079 4343

MluNI

2

3583 4625

MnlI

34

161 316 481(c) 534 617(c) 724 821(c) 969 1195(c) 1281 1296 1620 1680 1899 1918 1921 1967 2103 2304 2488 2526 2745 2927(c) 3012 3111(c) 3314 3375 3413 3440 3609(c) 3881 4164(c) 4215 4244

MroI

2

6 4080

MscI

2

3583 4625

MseI

16

85 813 1231 1407 1529 1551 2009 2059 2449 2491 4136 4317 4417 4438 4490 4632

MslI

4

290 3168 3599 4073

MspA1I

9

106 518 835 1007 1112 1982 3278 3907 4548

MspI

36

7 49 268 360 572 671 994 1052 1124 1150 1227 1656 1665 1874 2510 2524 2539 2548 2671 2831 2907 3067 3157 3395 3421 3622 3825 3912 3925 4001 4022 4081 4270 4285 4343 4765

MvaI

12

351 379 791 802 937 949 1626 3197 3580 4410 4658 4714

MvnI

19

835 1019 1372 1842 2106 2840 2955 3084 3111 3116 3177 3243 3372 3382 3527 3553 3675 3772 3934

MwoI

39

231 435 499 764 1013 1174 1661 1727 1734 1792 1814 1848 2086 2348 2357 2548 2559 2580 2771 2912 2938 3063 3072 3081 3179 3183 3188 3197 3297 3306 3555 3564 3589 3631 3696 3719 3798 4006 4554

NaeI

5

2540 2908 3068 3422 4002

NarI

5

2087 2551 2572 2686 3343

NciI

11

268 360 1053 1150 1666 2510 2672 3396 3622 4022 4344

NcoI

1

4587

NdeII

16

275 318 402 1385 1396 1843 1870 2512 2603 2962 3234 3265 3280 3597 4083 4184

NgoMI

5

2538 2906 3066 3420 4000

NheI

2

584 1724

NlaIII

24

648 1162 1224 1503 1850 2099 2630 2703 2849 2888 3074 3191 3319 3334 3391 3598 3732 3865 3943 3982 4509 4530 4591 4821

NlaIV

28

304 859 956 1573 1616 1826 1872 1917 2088 2507 2508 2514 2552 2573 2663 2687 2905 3026 3344 3393 3428 3463 3577 3620 3819 3999 4032 4424

NruI

1

3111

NspI

2

1162 2703

NspV

2

1320 4360

PflMI

4

344 3458 3507 4663

PinAI

4

670 993 3824 4284

PleI

4

719(c) 1149 2777 3860

PmeI

1

2450

PpuMI

3

2506 3576 3618

Psp1406I

2

3038 4803

PvuII

2

106 518

RcaI

2

2095 2626

RsaI

6

127 1660 2125 2303 2457 4475

SacII

1

836

SalI

1

2788

Sau3AI

16

275 318 402 1385 1396 1843 1870 2512 2603 2962 3234 3265 3280 3597 4083 4184

Sau96I

13

347 830 1667 1876 2506 2661 2936 3024 3273 3397 3576 3618 4031

ScaI

1

4475

ScrFI

23

268 351 360 379 791 802 937 949 1053 1150 1626 1666 2510 2672 3197 3396 3580 3622 4022 4344 4410 4658 4714

SfaNI

16

159(c) 437(c) 787(c) 885 1619(c) 1708 1732(c) 2539 2551 2785(c) 3160(c) 3172 3567 4088(c) 4098 4560

SfcI

2

1633 2270

SfuI

2

1320 4360

SgrAI

2

670 2547

SphI

1

2703

SspBI

1

2455

SspI

2

1421 4580

StyI

2

3506 4587

TaqI

14

247 745 1320 1519 1834 2065 2191 2209 2338 2789 3264 3405 4348 4360

TfiI

7

2369 2437 2989 3143 3441 3662 4539

ThaI

19

835 1019 1372 1842 2106 2840 2955 3084 3111 3116 3177 3243 3372 3382 3527 3553 3675 3772 3934

Tru9I

16

85 813 1231 1407 1529 1551 2009 2059 2449 2491 4136 4317 4417 4438 4490 4632

Tsp509I

16

2 1191 1439 1493 1553 1746 1926 2006 2010 3456 3470 4196 4350 4362 4444 4483

Tth111I

1

4344

Van91I

4

344 3458 3507 4663

XbaI

1

1425

XhoII

3

1870 2512 4083

XmaIII

1

3076

XmnI

1

640

 

        No cuts: AatI, AatII, Acc65I, AflIII, Alw44I, ApaI, ApaLI, AscI, Asp718, AvrII, BbrPI, BglII, BlnI, Bpu1102I, BsiWI, Bsp120I, BssHII, BstEII, BstXI, CelII, DraIII, Ecl136II, EspI, HpaI, KpnI, MfeI, MluI, MunI, NdeI, NotI, NsiI, PacI, PaeR7I, PmaCI, PmlI, Ppu10I, PstI, PvuI, RsrII, SacI, SapI, SexAI, SfiI, SmaI, SnaBI, SnoI, SpeI, StuI, SwaI, XcmI, XhoI, XmaI