Enzyme	# of cuts	Positions
AatII	2	1517 6565
Acc65I	1	850
AccI	2	3658 4374
AciI	99	76(c) 115(c) 125(c) 151(c) 189(c) 202 228 285(c) 511 518 637(c) 736 1008 1084(c) 1213 1428 1435(c) 1491(c) 1499(c) 1590 1622(c) 1688(c) 1694 1706(c) 1813(c) 1832 1878 1887(c) 2068 2091 2170 2325 2345(c) 2348(c) 2476 2522(c) 2573(c) 2648(c) 2712 2719 2866 2876(c) 2938 2999 3049(c) 3074 3077 3094 3159 3217 3244 3279 3316(c) 3319(c) 3379(c) 3395 3511 3522(c) 3561(c) 3586 3606 3617 3630 3698(c) 3737(c) 3762 3814(c) 3895(c) 3986(c) 3990 4009 4011(c) 4101 4440 4543 4599(c) 4609(c) 4633 4676(c) 4683(c) 4704(c) 4795 4823 4950 4969 5090 5200(c) 5335 5344(c) 5706 5797 5988(c) 6034 6155(c) 6199 6276 6385 6484(c) 6531
AcsI	4	674 1390 3898 4210
AcyI	6	237 1514 3042 3214 6180 6562
AflII	1	885
AflIII	7	660 2196 2976 3401 3653 4060 4750
AgeI	1	4066
AluI	26	45 64 309 447 652 890 986 1097 1277 2832 3132 3543 3906 4249 4393 4415 4510 4574 4692 4918 5008 5054 5311 5832 5932 5995
Alw44I	5	178 3239 3354 5064 6310
AlwI	17	845 895(c) 2161(c) 2311(c) 2311 2475(c) 2603 3644 4125(c) 5311(c) 5397(c) 5399 5495(c) 5496 5959(c) 6276 6280(c)
AlwNI	4	2604 3029 3780 5166
AosI	4	259 561 1036 5865
ApaI	1	4009
ApaLI	5	178 3239 3354 5064 6310
ApoI	4	674 1390 3898 4210
AseI	4	406 4521 4580 5815
AsnI	4	406 4521 4580 5815
Asp700	3	407 628 6242
Asp718	1	850
AspEI	1	5643
AspHI	7	182 2834 3243 3358 5068 6229 6314
AsuII	1	4016
AvaI	3	2232 3675 3993
AvaII	3	2435 5781 6003
AviII	4	259 561 1036 5865
BanI	9	236 430 850 1074 1086 1690 2142 4494 5591
BanII	3	2834 3883 4009
BbsI	2	2411 3663(c)
BbvI	30	54 242(c) 315(c) 441(c) 808 976 1049 1433(c) 1511(c) 1892(c) 1895(c) 2226 2763 2952 3045 3206(c) 3352 3420 3682(c) 3794(c) 4236(c) 4561(c) 4642(c) 4660(c) 5079(c) 5169 5172 5378 5681(c) 6072
BcgI	3	2203(c) 2530(c) 6182
BclI	3	2240 4105 4367
BfaI	8	444 841 858 4000 4177 5245 5498 5833
BfrI	1	885
BglI	4	252 1046 3167 5763
BmyI	12	182 435 577 2834 3020 3243 3358 3883 4009 5068 6229 6314
BpmI	5	1123 1621 2483 3897 5713(c)
Bpu1102I	1	3907
BpuAI	2	2411 3663(c)
BsaBI	3	842 2225 4366
BsaHI	6	237 1514 3042 3214 6180 6562
BsaI	3	481(c) 4054 5704(c)
BsaJI	13	355 936 1226 2133 2271 2360 2632 3296 3953 4009 4044 4489 4910
BsaWI	5	3449 4066 4956 5103 5934
BsgI	7	641(c) 1810(c) 2020 2233 2353 2821(c) 3793(c)
BsiEI	17	280 688 1017 1743 2091 2223 2676 2712 2999 3395 3606 3918 3990 4666 5090 6013 6162
BsiHKAI	7	182 2834 3243 3358 5068 6229 6314
BsiWI	1	3665
BsiYI	18	54 613 1148 1434 1705 1969 2106 2139 2505 2568 2637 3330 4045 4598 4772 4790 4956 5235
BslI	18	54 613 1148 1434 1705 1969 2106 2139 2505 2568 2637 3330 4045 4598 4772 4790 4956 5235
BsmAI	8	46(c) 481(c) 669 1521 2461(c) 4054 5704(c) 6480
BsmFI	5	590(c) 1123(c) 2599 3066(c) 3714
BsmI	2	4186 4279(c)
Bsp120I	1	4005
Bsp1286I	12	182 435 577 2834 3020 3243 3358 3883 4009 5068 6229 6314
BspDI	1	1718
BspHI	3	5470 6478 6583
BspMI	3	1668(c) 3540(c) 4386
BspWI	34	186 236 243 252 282 572 1016 1046 1055 1081 1349 2019 2049 2211 2727 2964 3039 3085 3167 3216 3340 3519 3536 3553 3704 3917 4395 4494 4538 4622 4689 4803 5375 5763
BsrBI	7	1499 3397(c) 3561 3992(c) 4442(c) 4683 6484
BsrDI	2	5704 5878(c)
BsrFI	6	683 687 2181 3913 4066 5723
BsrI	26	366(c) 392(c) 398(c) 863(c) 931 1153 1604 2542 2593 2679(c) 2763(c) 2845 3162(c) 3574 3729(c) 3747(c) 3930(c) 4550(c) 5158 5171 5283(c) 5689(c) 5807(c) 5850(c) 6119 6289(c)
BssHII	1	2392
Bst1107I	1	3659
BstBI	1	4016
BstNI	13	356 938 1065 1369 2462 3030 3297 3331 3876 4490 4778 4899 4912
BstUI	41	4 6 109 637 738 1299 1415 1435 1592 1696 1745 1880 2172 2198 2205 2219 2290 2392 2394 2396 2472 2503 2978 2995 3079 3224 3403 3522 3705 3707 3737 3814 4011 4062 4597 4599 4797 5378 5708 6201 6533
BstXI	4	870 3114 3731 3982
BstYI	10	837 900 3636 4130 5391 5402 5488 5500 6268 6285
Bsu36I	1	1118
CelII	1	3907
CfoI	46	6 109 239 260 562 1037 1058 1173 1352 1405 1417 1594 1698 1789 2045 2174 2219 2278 2292 2394 2396 2474 2730 2853 2953 3028 3224 3522 3549 3695 3707 3737 3913 4534 4599 4627 4660 4930 4997 5097 5271 5380 5773 5866 6203 6535
Cfr10I	6	683 687 2181 3913 4066 5723
ClaI	1	1718
Csp45I	1	4016
Csp6I	10	169 540 851 1597 2076 2388 2974 3666 4064 6122
DdeI	12	172 818 1118 1399 3058 3907 4127 5025 5434 5600 6140 6566
DpnI	34	279 839 845 902 1016 1112 1478 1742 2168 2222 2242 2305 2318 2482 2597 2675 3227 3638 4107 4132 4369 5318 5393 5404 5412 5490 5502 5607 5948 5966 6012 6270 6287 6323
DpnII	34	277 837 843 900 1014 1110 1476 1740 2166 2220 2240 2303 2316 2480 2595 2673 3225 3636 4105 4130 4367 5316 5391 5402 5410 5488 5500 5605 5946 5964 6010 6268 6285 6321
DraI	5	4096 4326 5509 5528 6220
DraII	2	4005 6619
DraIII	1	2084
DrdI	3	98 3003 4858
DsaI	6	1226 2133 2271 2360 2632 4009
DsaV	23	47 82 354 936 1063 1367 2327 2417 2460 2776 2953 3013 3028 3295 3329 3874 4488 4776 4897 4910 5128 5824 6175
EaeI	8	389 685 770 1365 2363 3987 4589 6031
EagI	2	685 3987
Eam1105I	1	5643
EarI	4	297 995(c) 4634 6438
Ecl136II	1	2832
EclXI	2	685 3987
Eco47III	1	2729
Eco57I	3	1628 5298 6310(c)
EcoO109I	2	4005 6619
EcoRI	1	3898
EcoRII	13	354 936 1063 1367 2460 3028 3295 3329 3874 4488 4776 4897 4910
EcoRV	2	2007 3972
Esp3I	4	46(c) 669 1521 2461(c)
EspI	1	3907
Fnu4HI	55	43 152 256 329 455 736 797 965 1038 1447 1500 1525 1590 1623 1689 1906 1909 2215 2346 2574 2719 2752 2866 2941 3034 3077 3217 3220 3317 3341 3409 3586 3617 3696 3738 3762 3808 3987 3990 4250 4575 4656 4674 4677 4795 4950 5093 5158 5161 5367 5695 6034 6061 6156 6385
FnuDII	41	4 6 109 637 738 1299 1415 1435 1592 1696 1745 1880 2172 2198 2205 2219 2290 2392 2394 2396 2472 2503 2978 2995 3079 3224 3403 3522 3705 3707 3737 3814 4011 4062 4597 4599 4797 5378 5708 6201 6533
FokI	20	91 335 437 579(c) 956(c) 1506 1946(c) 1996 2051(c) 2125 2413 2708(c) 2856 2869 2905 3076(c) 3500(c) 5609(c) 5790(c) 6077(c)
FspI	4	259 561 1036 5865
HaeII	12	240 1059 1353 1790 2279 2731 2854 2954 3029 3914 4628 4998
HaeIII	29	289 391 461 503 687 772 1006 1123 1292 1367 2099 2270 2365 3323 3334 3530 3585 3722 3989 4007 4591 4765 4776 4794 5228 5686 5766 6033 6620
HgaI	13	98(c) 1305 1734(c) 2296 2478 3031(c) 3068(c) 3075 3222 3711 4861 5439 6169(c)
HgiAI	7	182 2834 3243 3358 5068 6229 6314
HhaI	46	6 109 239 260 562 1037 1058 1173 1352 1405 1417 1594 1698 1789 2045 2174 2219 2278 2292 2394 2396 2474 2730 2853 2953 3028 3224 3522 3549 3695 3707 3737 3913 4534 4599 4627 4660 4930 4997 5097 5271 5380 5773 5866 6203 6535
HinP1I	46	4 107 237 258 560 1035 1056 1171 1350 1403 1415 1592 1696 1787 2043 2172 2217 2276 2290 2392 2394 2472 2728 2851 2951 3026 3222 3520 3547 3693 3705 3735 3911 4532 4597 4625 4658 4928 4995 5095 5269 5378 5771 5864 6201 6533
HincII	5	1320 1944 3772 4265 4375
HindII	5	1320 1944 3772 4265 4375
HindIII	3	650 888 4391
HinfI	15	708 811 1233 1800 1932 2151 2263 3871 3996 4054 4585 4650 4725 5121 5638
HpaI	3	1320 1944 4265
HpaII	30	49 83 500 684 688 1072 1090 1418 2182 2329 2419 2777 2944 2954 3014 3438 3450 3517 3914 4067 4468 4957 5104 5130 5320 5724 5758 5825 5935 6177
HphI	17	25 34 717 1449 1681 1720 2221(c) 2662 2890 3225(c) 4069(c) 4075(c) 5486(c) 5713(c) 6129 6335(c) 6370
ItaI	55	43 152 256 329 455 736 797 965 1038 1447 1500 1525 1590 1623 1689 1906 1909 2215 2346 2574 2719 2752 2866 2941 3034 3077 3217 3220 3317 3341 3409 3586 3617 3696 3738 3762 3808 3987 3990 4250 4575 4656 4674 4677 4795 4950 5093 5158 5161 5367 5695 6034 6061 6156 6385
KasI	1	236
KpnI	1	854
Ksp632I	4	297 995(c) 4634 6438
KspI	1	4012
MaeI	8	444 841 858 4000 4177 5245 5498 5833
MaeII	12	375 662 918 1187 1514 1755 1763 3668 5453 5869 6242 6562
MaeIII	29	57 348 368 439 922 942 1162 1188 1246 1360 1456 1510 1633 1647 1746 1948 2199 2509 2793 3063 4235 5106 5169 5285 5568 5899 5957 6110 6298
MamI	3	842 2225 4366
MboI	34	277 837 843 900 1014 1110 1476 1740 2166 2220 2240 2303 2316 2480 2595 2673 3225 3636 4105 4130 4367 5316 5391 5402 5410 5488 5500 5605 5946 5964 6010 6268 6285 6321
MboII	14	284(c) 624(c) 1012 1105(c) 1486 2416 3663(c) 3829 4621(c) 5412 5483(c) 6238(c) 6316(c) 6425(c)
McrI	17	280 688 1017 1743 2091 2223 2676 2712 2999 3395 3606 3918 3990 4666 5090 6013 6162
MfeI	1	4274
MluI	4	2196 2976 3401 4060
MluNI	1	772
MnlI	31	40 300 481 696(c) 996(c) 1113(c) 1152 1441 1596(c) 1875(c) 1930(c) 1973 2897 3067 3996(c) 4049 4054 4122 4301(c) 4310(c) 4350 4599(c) 4649 4858(c) 4932 5182(c) 5582(c) 5663(c) 5810 6016 6610(c)
MscI	1	772
MseI	26	143 340 406 886 953 1262 1319 1574 1943 2033 2609 3155 4095 4264 4325 4521 4580 5456 5508 5513 5527 5580 5815 5854 6219 6591
MslI	9	532 819 2234 2791 3183 3729 5895 6054 6413
MspA1I	18	115 309 986 1688 2070 2478 2868 3219 3246 3543 3632 3906 4011 4103 4574 5092 5337 6278
MspI	30	49 83 500 684 688 1072 1090 1418 2182 2329 2419 2777 2944 2954 3014 3438 3450 3517 3914 4067 4468 4957 5104 5130 5320 5724 5758 5825 5935 6177
MunI	1	4274
MvaI	13	356 938 1065 1369 2462 3030 3297 3331 3876 4490 4778 4899 4912
MvnI	41	4 6 109 637 738 1299 1415 1435 1592 1696 1745 1880 2172 2198 2205 2219 2290 2392 2394 2396 2472 2503 2978 2995 3079 3224 3403 3522 3705 3707 3737 3814 4011 4062 4597 4599 4797 5378 5708 6201 6533
MwoI	34	186 236 243 252 282 572 1016 1046 1055 1081 1349 2019 2049 2211 2727 2964 3039 3085 3167 3216 3340 3519 3536 3553 3704 3917 4395 4494 4538 4622 4689 4803 5375 5763
NaeI	2	685 689
NarI	1	237
NciI	10	49 84 2329 2419 2778 2955 3015 5130 5826 6177
NdeI	3	185 533 3851
NdeII	34	277 837 843 900 1014 1110 1476 1740 2166 2220 2240 2303 2316 2480 2595 2673 3225 3636 4105 4130 4367 5316 5391 5402 5410 5488 5500 5605 5946 5964 6010 6268 6285 6321
NgoMI	2	683 687
NlaIII	21	42 566 573 1561 1972 1983 2142 3005 3657 3830 4142 4389 4408 4754 5474 5965 5975 6053 6089 6482 6587
NlaIV	21	238 432 478 504 682 852 1076 1088 1692 2144 2352 3880 4007 4496 4782 4821 5593 5687 5728 5939 6529
NotI	1	3987
NspI	5	42 566 3657 4389 4754
NspV	1	4016
PaeR7I	1	3993
PflMI	2	2139 2505
PinAI	1	4066
PleI	5	3865(c) 4004 4644(c) 5129 5632(c)
PmeI	1	4096
Psp1406I	2	5869 6242
PstI	3	459 3969 4383
PvuI	6	280 1017 1743 2223 2676 6013
PvuII	5	309 986 3543 3906 4574
RcaI	3	5470 6478 6583
RsaI	10	170 541 852 1598 2077 2389 2975 3667 4065 6123
SacI	1	2834
SacII	1	4012
SalI	1	4373
SapI	1	4634
Sau3AI	34	277 837 843 900 1014 1110 1476 1740 2166 2220 2240 2303 2316 2480 2595 2673 3225 3636 4105 4130 4367 5316 5391 5402 5410 5488 5500 5605 5946 5964 6010 6268 6285 6321
Sau96I	14	287 502 1005 2435 3321 3583 3721 4005 4006 5685 5764 5781 6003 6619
ScaI	1	6123
ScrFI	23	49 84 356 938 1065 1369 2329 2419 2462 2778 2955 3015 3030 3297 3331 3876 4490 4778 4899 4912 5130 5826 6177
SfaNI	21	69(c) 163 199(c) 239 601 774 789 1145(c) 1158(c) 1965 2730 3105 3134 3366(c) 3420 3522 4208(c) 4847 5899 6090(c) 6339
SfcI	8	455 1282 3765 3965 4379 5015 5206 5884
SfuI	1	4016
SnoI	5	178 3239 3354 5064 6310
SpeI	1	857
SphI	2	566 4389
SspI	2	2124 6447
StyI	1	3953
TaqI	17	672 711 1718 1766 1935 2315 2789 3128 3302 3839 3994 4016 4052 4114 4374 4850 6294
TfiI	10	708 811 1233 1800 1932 2151 2263 4054 4585 4725
ThaI	41	4 6 109 637 738 1299 1415 1435 1592 1696 1745 1880 2172 2198 2205 2219 2290 2392 2394 2396 2472 2503 2978 2995 3079 3224 3403 3522 3705 3707 3737 3814 4011 4062 4597 4599 4797 5378 5708 6201 6533
Tru9I	26	143 340 406 886 953 1262 1319 1574 1943 2033 2609 3155 4095 4264 4325 4521 4580 5456 5508 5513 5527 5580 5815 5854 6219 6591
Tsp509I	21	403 407 628 674 874 1301 1390 1712 3151 3709 3714 3898 3960 4210 4274 4430 4447 4522 5510 5816 6071
Van91I	2	2139 2505
XbaI	2	840 3999
XcmI	2	3111 3856
XhoI	1	3993
XhoII	10	837 900 3636 4130 5391 5402 5488 5500 6268 6285
XmaIII	2	685 3987
XmnI	3	407 628 6242